第二種：袁世凱見慈禧一病難起 ， 怕慈禧死后 ， 光緒掌握實權 ， 報復自已在戊戌變法出賣皇帝的行為 ， 于是賄賂宮廷宦官 ， 用劇毒藥物害死光緒帝 。 這種說法最有權威的依據是清朝最后一個皇帝溥儀的說法 ， 溥儀說：“我親耳聽到一個侍候光緒帝的老太監講：‘光緒帝死前一天 ， 只是用了一劑藥 ， 才變壞的 。 后來才知道這劑藥是袁世凱送的 。 ’”

第三種：太監李蓮英得悉光緒帝的日記中載有西太后死后將誅袁世凱和他的消息 ， 與慈禧一起陰謀將毒藥投入光緒帝的食物中致使光緒帝中毒身亡 。

第四種：這幾年來有專家根據光緒帝生前的病歷 ， 結合當時的歷史背景和現代中醫學理論 ， 推斷是光緒帝因為嚴重肺結核病加上其它并發癥 ， 導致死亡的 。

第五種：光緒帝有嚴重的腎虧 ， 加上光緒帝從小身體虛弱 ， 從幾歲起就受慈禧的壓制 ， 長期處在緊張之中 ， 后來又在做皇帝時更是經歷一連串的挫折和打擊 ， 病情逐漸加重 ， 引起一系列呼吸道、消化道、等并發病癥 ， 最后病亡 。 這一說法主要依據是光緒生前的病歷和光緒生前自已的一段回憶 。