然而 ， 在運送到成功大學檢驗、行經臺南西門路時 ， 鯨魚尸體突然爆裂 ， 龐大的腸子、脂塊與幾公升的血 ， 以爆炸般的威力將附近商店、住家、街道、汽機車染成一片血紅 ， 行人被嚇到驚慌失措 。 更恐怖的是 ， 尸體的腐臭味久久無法散去 ， 幾個月下來都無法擺脫這種令人作惡的腥臭味 。

鯨爆事件也引起各國科學家關注 ， 國家地理頻道甚至制作了專題報道《掠食者犯罪現場：鯨爆之謎》 。 研究者表示 ， 擱淺的鯨魚會爆炸 ， 可能是因為鯨魚死亡后 ， 內部組織和器官迅速腐敗 ， 細菌急速擴散導致蛋白質快速分解 ， 最后產生大量甲烷、氨和氫硫化物等氣體 ， 使鯨魚的尸體不斷腫脹 ， 宛若一顆氣球 。 當鯨魚壓力過大時 ， 一個切口可能就會引爆體內的氣體瞬間沖出 。