肌酸对一般人来说最常见的副作用是些微的腹泻，若过量使用不当，可能产生之副作用包括：造成肌肉拉伤；产生体水滞留，增加心脏负荷；肾脏功能不佳者产生肾衰竭；饮水量增加造成电解质稀释而引起抽筋或呕吐；肠胃不适（下痢） 。若本身有肾脏疾病史，建议使用前先咨询专业医师 。
吃了肌酸就可以有效果吗
这完全是个迷思 。肌酸再神奇，也不可能让本来身体构造不同的人，体能变得一样好 。由于肌酸需依靠身体吸收并产生作用，而这个身体吸收的效率，会依每个人基因不同而有所变动 。的确有些人是对肌酸完全没有反应的 。
另外，肌酸的功能只是帮助肌肉获得更多可消耗的能量 。吃了肌酸后，还是要搭配适当的训练才有效果 。除了训练以外，也要补充足够的营养，象是乳清蛋白，便是想要看到运动健身成效不可少的营养元素 。

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