等位基因对表型的影响往往不止一个 。 当一个等位基因对表型有多个影响时 ， 就称为多效性 。

例如 ， 在X染色体的顶端有一个叫做Xq28的区域 ， 这个区域与男同性恋有很高的相关性 。 但有人可能会猜测 ， 这种基因应该已经被自然选择淘汰了 ， 因为同性恋者是没有孩子的 。

就同性恋而言 ， Xq28上的“同性恋等位基因”并不是隐性的 。 Y染色体没有相应的位点 ， 所以同性恋等位基因是有性联系的 。 遗传了这种基因副本的男性很可能会受到这种基因的影响 ， 无论是否同性恋 。

Xq28的“同性恋”版本确实与男性的强制性同性恋有关 。 然而 ， 这种基因的“同性恋”版本也使得女性比“异性恋”版本的女性更早进入青春期 。 在过去 ， 基因定量可以保证拥有“同性恋”等位基因的女性比其他女性生育更多的孩子 。