由于在华北长期与共产党合作 ， 熟悉游击战术 ， 1940年任湘鄂赣边区总指挥 ， 兼南岳游击干部训练班教育长 ， 与八路军教官共同培养抗日游击战指挥员 。 1941年底 ， 奉命与英军军事代表团合作训练突击部队 ， 任陆军突击总队司令 ， 后任十四、二十六、三十八集团军副总司令 ， 三十二集团军总司令 。 1945年当选为国民党第六届中央执行委员 ， 奉命主持浙东地区日军受降事宜 。

后来李默庵移居国外 ， 但仍心向祖国 ， 经常在当地中文报刊上发表赞誉祖国的文章 。 而且跟黄埔一期同学宋希濂、侯镜如等在华盛顿发表宣言 ， 呼吁军校同学发扬黄埔精神 ， 为促进中国统一而奋斗 。 后来于1990年回祖国定居 ， 致力于祖国统一事业 ， 任黄埔军校同学会副会长 ， 全国政协第七、八届常委 。 2001年10月27日因病在北京逝世 ， 终年97岁 。