支气管：吸烟是导致慢性阻塞气管疾病的主要发病因素 。因为吸烟能引致支气管上皮细胞的纤毛变短和不规则及其和运动发生障碍 ， 降低局部性抵抗力 ， 容易受到感染 。
肝脏：吸烟会加重肝脏负担 。经常抽烟会影响肝脏的脂质代谢作用 ， 令血中脂肪增加 ， 使到良性胆固醇减少 ， 恶性胆固醇增加 。这个原因令肝脏的解毒功能增加负担 。
肠：吸烟会导致结肠癌 。患此癌的机会则与吸食烟草的份量成正比 。研究显示停止吸烟虽然可以减低其他疾病例如心脏病、肺癌等的机会 ， 但患上结肠癌的危险就仍然非常大 。
眼部：吸烟会引起白内障 ， 影响视力 。研究显示每天吸烟超过一包的白内障患者是从不吸烟者的2倍 。
生殖系统：吸烟对脊髓的神经中枢起抑制作用 ， 使吸烟男人性欲变弱 ， 又由于吸烟能使血管收缩、痉挛 ， 引起末梢血循环障碍 。因此 ， 吸烟是导致阳萎的最主要原因 。澳洲和加拿大已在香烟盒上直接了当地印上这个信息 。另外 ， 吸烟可影响精子的活力 ， 使畸形精子增多 ， 停止吸烟三至六个月后 ， 方可恢复正常 。如想要一个聪明、健康的孩子 ， 婴儿专家提倡一定要停止吸烟三到六个月 。
心脏及血管：吸烟会使脂肪积聚、血管闭塞 ， 令吸烟者容易患冠状动脉心脏病 。因吸烟而导致的心脏病死亡率占全部的25% 。50岁以上吸烟人士的患病率提高2倍 。50岁以下吸烟人士的患病率提高9至14倍 。吸烟令血管收缩 ， 减慢血液及氧份循环 ， 最终导致血管壁变厚 ， 诱发冠心病及中风 。吸烟会令手脚血液流通完全受阻 ， 以致截肢 。
二手烟：二手烟是由香烟、烟斗或雪茄燃烧时 ， 飘出来或吸烟者抽烟时呼出的一种混合烟雾 。在许多吸烟的场所中 ， 二手烟是最常接触到的污染物 。抽烟时喷出的烟雾可散发超过四千种气体和粒子物质 ， 大部分这些物质都是很强烈的刺激物 ， 其中至少有四十种在人类或动物身上可引致癌病 。在抽烟者停止吸烟后 ， 这些粒子仍能停留在空气中数小时 ， 可被其他非吸烟人士吸进体内 ， 亦可能和氡气的衰变产物混合一起 ， 对人体健康造成更大的伤害 。
当吸烟危害吸烟者本身健康的同时 ， 二手烟也影响非吸烟者 。除了刺激眼、鼻和咽喉外 ， 它也会明显地增加非吸烟者患上肺癌和心脏疾病的机会 。如果儿童与一些吸烟人士同住的话 ， 他们的呼吸系统会较容易受到感染 。其他影包括增加咳嗽、气喘、痰多、损坏肺部功能和减缓肺部发育 。