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业内人士表示，许多产品宣传都是罗列一大堆文献中提到过的功能，但是这些功能可能跟他们的益生菌产品毫无关系 。
他指出，要证实益生菌产品的健康功能，是需要进行临床研究的，且周期长、成本高、通常还需要大量的志愿者，但市场上卖的“益生菌”产品很多都没有实现 。
恰恰模拟胃酸消化存活率低、无抑菌功效、活菌数“缩水”等检测中暴露的问题也侧面印证了益生菌产品的品质参差不齐，鱼龙混杂 。
当然，盲目食用益生菌也可能带来健康风险：益生菌携带的耐药基因转移到人体，引起耐药性问题 。
有专家指出，抗生素能杀死致病菌，而对含有抗生素抗性基因的益生菌无效，这是好事 。但是，如果这个抗性基因被致病菌‘盗取’，那将后患无穷（产生耐药性） 。
值得注意的是，中国的益生菌评审机构目前尚未对益生菌的耐药性问题做出明确的规定 。所以，市售益生菌产品安全性难以作出恰当的评价 。
作为消费者，在遇到胃肠健康问题时不应该滥用益生菌，应该及时就咨询医师，并在相应的指导下决定是否食用特定的益生菌 。

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