后来在外交官梁诚的艰苦努力下 ， 美国同意将当时清廷尚未付足之款项约一千多万美元（应付美国赔款三千两百多万两 ， 折合两千四百多万美元）退还给中国 。 这批庚子退款 ， 别的国家没有响应 ， 因此首批庚子退款的国家 ， 只有美国一个 。

但是美国的退款是有条件的 ， 清政府必须将这笔退款用于中国教育 。 当时决定的项目有两个 ， 一是办清华学校 ， 二是资助中国留美学生 。 美国的目的是希望通过吸引中国学生来美留学 ， 以打造一批为它从知识、精神上支配中国的新的领袖 。 不过 ， 不管怎么样 ， 对中国来说 ， 办学之举利国利民 。

根据中美双方的商定 ， 清政府在北京建造一所留美训练学校 。 北京遂于1909年6月设立游美学务处 ， 此即清华大学的雏形 。