退役后的孙继海，曾经选择经商，之后，他担任国奥选拔队主帅，再之后，孙继海作为国奥助理教练，辅佐希丁克 。
当希丁克因为国奥队战绩不佳而下课后，孙继海选择主动辞掉了助理教练的职务 。
2019年3月，孙继海当选新疆足协副主席，此外，他还担任新疆足球的青训总监 。
对于自己当选新疆足协副主席这事，孙继海调侃地告诉采访人员：“这回算是人生巅峰了！”
对于今后工作的重心，孙继海说：“……使命就是帮助新疆足球建立科学完善的青训系统，发掘更多人才……”
2019年4月，孙继海参加了央视财经频道的一档访谈节目时，谈到了中国足球 。
对于中国足球目前的水平，孙继海这样告诉主持人：“……我们联赛的水平，通过引援，大投入，联赛关注度、上座率，从这些层面上我们进步是足够快的，但这并不能完全改变中国足球水平的现状，最突出的一点就是青训 。”
当谈到“中国足球想要发展，希望改变的是什么”这个话题时，孙继海这样说：“我希望，而且是最难的改变做起来，青训，青训做好了，有人，有俱乐部的成绩，有国家队的成绩，中国足球就一片繁荣！”
在节目中，对于自己目前的职务和“任务”，孙继海这样说：“我不确定中国足球未来能够发展到哪一步，我也不知道自己究竟能带来多大的改变，但是我愿意为此做出我的努力！”
2019年4月28日，孙继海出席了2019年清华大学体育产业创新创业高峰论坛，他以“足球青训新思路”为题展开了演讲，他在演讲中，特意指出了国内一些青训机构的教练不够专业的事实 。
对于孙继海在论坛上指出的“一些青训机构教练水平参差不齐”的事实，有网友这样说：“国内很多青训教练，无论做人素质还是专业知识，都不敢令人恭维！误人子弟的青训教练不少！孙继海讲的就是真话！值得点赞！”
当球员时，孙继海在国内足坛名气很大，如今退役后，他积极投身青训，为中国足球培养更多人才，可谓是专业的人干专业的事，也是正能量的事！祝福孙继海今后在足球领域能做出好的成绩 。