
文章插图
作者:麦子
数据可视化真是一个蛮头疼的问题,你不停地寻找最恰当的表达方法,让好不容易做出来的实验显得更惊艳 。但有时候你踏破铁鞋终于找到了,做好了,写完文章投出去了,突然审稿人提了一些出乎意料的意见,这时头疼就变成了蛋疼 。
【奥维地图看风水 奥维地图显示截断风水】比如,有时候我们会遇到一个很崎岖的数据集,有某组特大,有某组特小,于是你做出来的就是这样的:

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正确是正确,但就是有点别扭 。如果我想让B、C两组显得更清楚些,那么截断图是一个常规选则,像这样:

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Y轴断成了两截,一截是0~15,一截是60~80,这样我就可以看到那两组数值较小的数据的变化 。如果B、C两组本来没多大意义,那不看也罢 。但万一是两组药物把某个指标从A的高值降到这么低,我就很想展示它们之间的差别,现在C组的离散程度就比B组小 。
这样操作起来也容易,就在Graphpad里进行 。
Graphpad中截断图的做法
做好上面那张原图之后,双击Y轴,在弹出的对话框中选择Left Y axis选项卡 。接下来第一行就是Gaps and Direction,点开下拉框,根据情况选2截或3截,本例中就选2截,图标方向随意 。

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此时下方多一了行,下拉框有Bottom和Top,分别选中后可对上下两截Y轴进行设置,如图将下半截设成0~15 。同理选择Top后将上半截设成60~80 。

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左边的百分比则是上下两截在视觉上各占Y轴全长的比例,只要设一个,另一个会自动根据总和100%来变化 。这几个数值可根据实际情况调整,直到看起来舒服,就得到第2张Y轴分截的图 。
其他细节如字体字号啥的也在这里设置好 。然后兴冲冲地把文章投出去……
可这点功夫打不过人家啊!
一般情况下也不会有什么问题吧,这个做法也比较常见 。直到有一天,我发现R语言常用的做图包ggplot2不能这么做 。咦?这不是传说中功能完善、做图严谨又漂亮的包吗?居然这么水?!
细查之下,发现不是水,而是开发这个包的小哥哥不!愿!意!我有技术我任性!
你问他为啥,他是这么说的:

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https://groups.google.com/forum/#!topic/ggplot2/jSrL_FnS8kc
对,不能做,因为本宝宝不喜欢 。这样会对数据造成视觉上的扭曲 。最好做两张图,一张是所有数据,一张只有数值小的,这样你就能看到大值如何碾压小值 。
这可一语惊醒梦中人 。数据可视化,追求的不仅是视觉上看着舒服甚至“酷炫”,其第一要义当然是数据的严谨呀!
不过,他说两张图?会不会太占空间了?
看看上面的原图,右边两组矮下去的部分留出了一大片空白,能不能把那张小数值的塞进去?
Graphpad中嵌合图的做法
还是那张原图 。做好以后,New→New Graph of Existing Data,新建一张图 。然后在弹出的对话框中选择好相应的图形,勾选Plot selected data sets only之后,点Select选择两组小数值 。

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然后设置图片外观啥的我就不说了,直接看排版 。继续新建,New Layout,在弹出的对话框中可以看到嵌入式,就它了~
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