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环状RNA已被证实参与人类基因组的许多过程 , 但其在血管衰老中的功能仍在很大程度上未知 。 在本研究中 , 作者通过miRNA pull down、双荧光素酶报告实验、以及一些细胞表型实验证实了 ciPVT1在内皮细胞衰老中的功能 。 ciPVT1通过海绵机制调节miR-24-3p并进一步上调CDK4的表达 , 导致Rb磷酸化增强 。 此外 , 过表达ciPVT1逆转了miR-24-3p在内皮细胞中的衰老诱导作用 。 总之 , 本研究揭示了ciPVT1在调节内皮细胞衰老中的关键作用 , 并可能对寻找对抗年龄相关血管病变发展的策略具有重要意义 。
云序生物环状RNA研究优势
云序生物作为国内早期提供环状RNA测序的测序公司 , 自行建立的环状RNA数据库circDB , 凭借物种覆盖广、数据量大、疾病背景多的特点为客户提供优质的服务 。 云序积累了超过10000例环状RNA测序的经验 , 样本覆盖20多个物种以及50多种疾病 。 云序生物提供系统性环状RNA服务 , 从筛选(circRNA测序)到验证(qPCR)再到机制研究(RIP、RNApull-down、ChIP)以及上游表观调控(m6A甲基化等各类RNA修饰研究) , 全方位的覆盖环状RNA上下游分子机制验证的重要研究环节 。 除了提供组织和细胞的样本类型测序之外 , 我们还提供体液、血清血浆、外泌体石蜡样本等特殊样本的测序服务 。
云序环状RNA课题技术服务四大模块
一、环状RNA筛选:
1.1 circRNA测序
1.2 全转录组测序(同时检测circRNA、lncRNA、mRNA)
二、环状RNA验证
2.1 qRT-PCR
对选定目标RNA分子可进行qPCR检测服务 , 包括引物设计与表达鉴定 。
2.2 Sanger测序 与RNase R酶耐受实验
对选定的环状RNA分子进行反式剪切位点引物设计 , 扩增后Sanger测序验证环状;使用RNase R酶处理环状RNA分子 , 验证环状RNA分子稳定性 。
三、 CircRNA功能机制研究
3.1 RIP测序/RIP-qPCR
针对目标蛋白抗体把蛋白-RNA复合物沉淀下来 , 并对复合物上的RNA进行测序或对目标RNA进行qRCR表达分析 。
3.2 RNA pull-down+MS/WB/qPCR/RNA-Seq
设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来 , 蛋白质谱检测或WB检测与RNA结合的蛋白 。 设计目标RNA生物探针把相应的结合蛋白质与RNA复合物沉淀下来 , qPCR检测或RNA-seq检测与RNA结合的RNA 。
3.3 双荧光素酶报告实验
双荧光素酶报告实验检测两个基因之间的互作 。
3.4 ChIP-seq/ChIP-PCR
检测转录因子或者组蛋白与下游基因的结合情况 。
四、CircRNA修饰研究
4.1 m6A/m5C/ac4C/m7G/m1A等修饰
针对环状RNA各类修饰进行高通量筛选 。
4.2 MeRIP-circRNA-PCR验证
对高通量测序的结果 , 通过qPCR进行进一步验证 。
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