马耳他骑士团的全名为：耶路撒冷、罗得岛及马耳他圣约翰主权军事医院骑士团 ， 从这个名字上 ， 我们可以清晰知道 ， 耶路撒冷、罗得岛及马耳他圣约翰等三个地方曾经都是马耳他骑士团的国土 。 马耳他骑士团是中世纪十字军东征时的产物 ， 当时的罗马教皇为保护十字军东征的成果 ， 帮助中东新生的基督国耶路撒冷王国、安条克公国、的黎波里伯国、埃德萨伯国抵抗穆斯林的进攻 。

于是罗马教皇就组建了三大骑士团 ， 它们分别：医院骑士团、圣殿骑士团和条顿骑士团 ， 派遣它们赶赴中东抵御穆斯林的进攻 。 与此同时 ， 教皇为了使得骑士团的战斗力得到最大的发挥 ， 于是给予骑士团“国家”待遇 ， 不受制世俗王权 ， 所占用土地 ， 主权归自己所有 。