效果图如下:

文章插图
《Graphpad,经典绘图工具初学初探》一文中介绍了graphpad入门的基础知识,基本操作可以单击回看 。最近使用graphpad发现其多图排版功能十分强大,不仅可以实现多个图形排版还能实现图层叠加 。上面这个图的作图思路也就是把该图拆分为两部分,Enrichment score和基因位置分布条带图 。
在GSEA分析结果文件夹里随便找一个感兴趣的GO条目分析结果Excel表,作图需要提取的信息即图中标黄的部分,RANK IN GENE LIST和RUNNING ES 。

文章插图
加工一下已有数据,添加一列high取值都为0.1,设置高度,黄色部分的数据就是用来绘制基因位置分布条带图的;绿色部分用来绘制动态的ES评分曲线 。

文章插图
打开graphpad之后,我们在XY类图下选择Enter and plot a single Y value for each point,将两部分数据分开粘贴到软件不同数据表格中(如下图左侧所示),下图中间展示两个图选择的不同绘图方式,调整参数后最终得到右侧的结果 。

文章插图
在左侧目录树处点击layout创建一个图形排版界面,将Graphs下的图形复制粘贴到layout1下,拖拉移动位置很快就能将两部分图对齐 。

文章插图
之后用同样地方式画另外一个富集结果,粘贴到layout1中便得到最开始展示的图 。
注意:设置X轴的范围是1到总排序基因数,Y轴是0到多个富集分析得分的最大值 。
- GO、GSEA富集分析一网打进
- GSEA富集分析 - 界面操作
- 无需写代码的高颜值富集分析神器
- 去东方,最好用的在线GO富集分析工具
- 没钱买KEGG怎么办?REACTOME开源通路更强大
- 超简便的国产lncRNA预测工具LGC
- 我想做信号通路分析,但我就是不想学编程
- 这个只需一步就可做富集分析的网站还未发表就被CNS等引用超过350次
- 收藏 北大生信平台” 单细胞分析、染色质分析” 视频和PPT分享
- Science: 小鼠肾脏单细胞转录组+突变分析揭示肾病潜在的细胞靶标
- 10X单细胞测序分析软件:Cell ranger,从拆库到定量
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一)- 引言
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(二)- 实验平台
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(三)- 原始数据质控
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(四)- 文库拆分和细胞鉴定
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(五)- STAR, Kallisto定量
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(六)- 构建表达矩阵,UMI介绍
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七)- 导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(八)- Scater包输入导入和存储
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(九)- Scater包单细胞过滤
- Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(十)- Scater基因评估和过滤
- 中国研究生准考证打印 研究生考试准考证打印要求
- 英语四级考试考什么 四级英语总分多少
- 天津会计初级考试 天津会计考试
- 四级考试时间 四级考试报名条件
- 英语口语考试常用对话 英语口语考试对话内容
- 公共英语等级有几级 全国公共英语等级考试
- 会计初级证书报名条件 会计初级职称考试报考条件
- 造价工程师入门手册书籍 造价师考试用书
- 幼儿教师招聘考试试题及答案?
- 广东省公务员考试成绩怎么查询?
特别声明:本站内容均来自网友提供或互联网,仅供参考,请勿用于商业和其他非法用途。如果侵犯了您的权益请与我们联系,我们将在24小时内删除。
