分子对接常用软件 A:请教前辈们一个问题：DS、MOE、Autodock、schrodinger 这四个软件 ， 哪一个用来做分子对接接更好一点?
殷赋科技:薛定谔没用过 ， 我推荐用Dock6 。
B:薛定谔挺准的 ， 不过操作不友好 。
A:那发文章啥的 ， 用哪个合适 ， 感觉schrodinger界面更精致 。
殷赋科技:你用什么软件做计算 ， 就用什么写文章 ， 不过要注意 ， 商业软件需要有版权 。
A:那就貌似用autodock不用有版权吧 。
C:我觉得花钱的好 。
殷赋科技:autodock 引用文献就好 。
A:花钱是挺好 ， 但是没有钱呢!
殷赋科技:这些商业软件当然贵了 ， 大多数功能模块都是用不着的 。 你们还在纠结这个问题 ， 用dock6啊 ， 免费又准确 。
虚拟筛选费用 E:这两天用vina筛一个二十多万的分子库 ， 费了一个多星期 ， 不知道算不算正常?
E:28核CPU 。
殷赋科技 :正常
F:假设是22万化合物 ， 那么你的筛选速度相当于每核心每化合物1.3分钟 。 对vina来讲正常了 。 但是 ， 你可以租赁计算机 ， 一台机器一周7天大约500元 。 你用7个节点 ， 500元一天搞定 。 14个节点 ， 500元 ， 半天搞定 。
殷赋科技:求推荐 。
F :广州超算中心 ， 就是贵一倍1000元也值 。
E:这么计算 ， 确实很值得 ， 看来现如今计算资源才是王道啊 。
殷赋科技:用起来吧!高效地发文章 。
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