又一篇!云序circle-seq助力环状DNA在食管鳞癌当中的研究( 三 )


云序生物eccDNA测序
云序生物是国内最早提供环状DNA测序服务的公司 , 早在2018年已启动了环状DNA测序技术的开发 。 2019年 , 云序率先发布了组织细胞环状 DNA 测序(circle-seq) , 并成为A&A Bio独家代理(该品牌的环状 DNA 纯化柱被绝大部分环状DNA高分文章采用) 。 2020年 , 云序又相继发布了血清血浆环状DNA测序及血清血浆环状DNA甲基化测序服务 , 均为全国首发 , 并成为国内环状DNA产品线最全的测序公司 。 迄今为止 , 我们已经完成上千例样品的环状DNA测序 , 积累了丰富的项目经验 , 样品类型涵盖:组织﹑细胞﹑血清﹑血浆﹑尿液等 , 物种涵盖:人﹑小鼠﹑大鼠﹑拟南芥﹑果蝇﹑酵母﹑非洲爪蟾等 。
云序生物eccDNA相关产品
组织细胞环状 DNA 测序
血清血浆环状 DNA 测序
血清血环状 DNA 甲基化测序
环状 DNA Sanger 测序验证
【又一篇!云序circle-seq助力环状DNA在食管鳞癌当中的研究】A&A Biotechnology 环状 DNA 纯化柱
1.组织细胞环状DNA测序
云序生物基于circle-seq的方法 , 采用多种手段包括柱纯化去除基因组DNA、酶消化去除线性DNA和线粒体DNA、滚环扩增放大信号 , 高效地纯化和富集环状DNA , 再利用NGS测序和生信分析识别环状DNA 。 结合优化的实验流程 , 本环状DNA测序服务具有检出率高﹑准确性好等优点 。
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云序生物eccDNA测序实验示意图
技术优势:

  • 使用原装A&A biotechnology纯化柱高效富集环状DNA
  • 滚环扩增放大环状DNA信号 , 提高检出率
  • 专业的生信分析:详尽的注释、丰富的图表
2.血清血浆环状DNA测序
针对血清血浆微量样品 , 云序生物参考卢煜明教授团队开发的方法 , 酶切去除线性DNA后 , 利用Tn5转座酶 , 打开eccDNA环状结构并同时在DNA片段两端加上接头 , 进行建库及测序 。 Tn5转座酶法效率高 , 损耗低 , 实现血液循环系统中微量的环状DNA的检测 。 并且本产品能保留环状DNA的原始表达量 , 使得不同环状DNA间的表达量的比较更为准确 。
技术优势:
  • 减少DNA损失
  • 保留原始表达量 , 不同环状DNA间表达量比较更准确
3.血清血浆环状DNA甲基化测序
针对血清血浆样品 , 云序参考卢煜明教授团队今年研发的方法 , 酶切去除线性DNA后 , 利用Tn5转座酶 , 打开环状DNA环状结构并同时在DNA片段两端加上接头 , 并用酶转化法将未甲基化的C转化为U , 进行建库及测序 。 一次建库测序中同时检测样品中环状DNA及其甲基化位点的信息 。
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技术优势:
  • 一箭双雕:同时检测环状DNA及其甲基化状况 , 节约样品 , 性价比高
  • 单碱基分辨的环状DNA甲基化分析
4.环状DNA sanger测序
针对测序项目中筛选出的环状DNA , 云序提供sanger测序服务验证环状结构 。 其主要目的在于:为用户提供一种低成本的扩大样品量验证手段 , 节约实验成本 。 通过设计反向引物进行PCR扩增 , 将覆盖环状DNA连接位点的扩增产物进行sanger测序 , 验证连接位点处序列 。
5.A&A Biotechnology 环状 DNA 纯化柱
A&A Biotechnology的纯化柱 , 是绝大部分环状DNA高分文章中所使用的纯化柱 。 云序生物是该品牌在国内的唯一总代理 。
云序生物服务优势
优势一:提供环状DNA测序服务和环状DNA甲基化测序的公司 。

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