单位重要领导和下属有矛盾，他有权力开除这位在编职工吗？答案是“不行” 。你说气人不？别说是开除、辞退，即使是调整个单位，调去别的部门，单位领导也没有这个权力 。甚至包括停发工资、停发地方财政承担的福利补贴，罚款什么的，都不行 。唯一能做的，就是调整岗位，或者晾起来，不给安排分工，不给考核评奖等 。
机关事业单位的在编人员，其聘用、招考、辞退、开除，都有专门的流程，也有专门管理的单位，公务员由组织部下属的公务员管理机关管理，事业人员和工人由人社局管理，单位只有用人权 。同样，公务员由《公务员法》规范，出现《公务员法》规定的辞退或者开除情形，才能由公务员管理机关开除，而不是单位作主 。事业人员由《事业人员管理条例》规范，同样是出现法律法规规定的情形，才能开除 。
机关事业人员的工资，都是由人社部门的相关机构，按照各自的标准，和个人具体条件，自行核准，自行晋升，单位同样做不了主 。单位只负责考核，如果考核合格，工资按正常程序晋升；如果考核不合格，人社部门也会按相关规定处理 。并不是说单位可以根据个人的表现，出于奖励目的多给甲晋升一级，或者出于处罚目的少给乙晋升一档 。如果单位想扣发某个职工的工资，也必须是出现规章制度规定的情形，才可以由人社部门执行 。比如因病因事长期请假，一年内超出一定时限的，或者长期离岗“吃空饷”的等等 。
即使职工犯错，单位想处罚，也没有多少可行的措施 。比如迟到早退，或者完不成工作任务，单位按规章制度，罚个二十三十，甚至五十一百，这是可以的，但罚款数额过大，一次三五百，这就不合适了，单位没有那么大的权利，规章制度也不行 。
单位职工出现不重大过错，如果达到法律条例规定的情形，单位可以向公务员管理机关，或者是人社部门建议，按程序开除或者辞退，这一般是长期离岗人员、吃空饷人员，或者因醉驾或其他原因入刑的人员，才有的待遇 。如果达不到法律条例规定的情形，有其他不适宜从事目前工作岗位的情形，单位可以向组织、人社部门建议，调整其单位、岗位，却没有办法进一步处理 。一切都要依法办事，即使是单位或者一把手，也不能随心所欲 。
我就题主提出的问题，谈一下个人的看法 。
先说结论：在体制内的机关、事业单位，如果职工没有严重的违法违纪问题，不论你多大的领导，多高层级的单位，也没有权利擅自开除在编职工 。为什么这样说呢？
首先，就目前的法律、法规来说，有编制的职工，无非就是两类人：1、党政机关的公务员和少量的机关工人 。这类人员的综合管理，必须严格按照《中华人民共和国公务法》的法律规定办事 。2、事业单位的管理人员、专业技术人员、工勤人员 。事业单位工作人员的综合管理，必须按照《事业单位人事管理条例》的规定办事 。这是首先必须弄清楚的理论前提 。
总体而言，公务员实行的是行政编制，主要就是取得公务员身份 。事业单位实行的是事业编制，具体分以上三种编制类型 。之所以实行严格的编制管理，根本目的是为了从总体上控制住机构数量和机构内的人员数量，防止机关、事业单位工作人员数量的无限膨胀，减轻财政负担，提高工作效率 。
其次，开除是最重、最严厉的政务处分 。机关、事业单位的职工被开除之后，立即失去公职人员身份，中断与单位的人事关系，彻底失去了工作，完全停发工资福利待遇，成了事实上的失业人员 。
更为严重的是：体制内工作人员被开除公职，还肯定伴随着视同缴费年限被彻底清零，这会导致视同缴费年限比较长的人，因累计缴费年限无法达到15年的最低要求，而无法正常办理退休手续，自然也就无法领取基本养老金 。因此，开除处分的法律后果是极为严重的 。几乎等同于自杀未遂 。

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