同时，在调查之初，虹桥塔台与机长对于是否是跑道侵入有很大分歧，关键点就在是起飞航班离地后发的穿越指令还是在滑跑时就发了穿越指令，管制员这边意思是看到空客320飞机已经要离地了才发指令让那架空客330飞机穿越跑道，因为从机组接到指令，再加油门移动还需要一个时间，而且在起飞的320机组质疑之后，管制员让那架空客330飞机原地等待，起飞的飞机继续起飞！这个意思可能是塔台观测到的是当时穿越飞机并未过等待线，如果这个是真实的，那么当时穿越飞机在等待线外并且执行了暂停穿越的指令，这起事件就成了320机长这边目视错误了，而且也就没有空客320起飞的时候从空客330正上空飞过的可能了，当然了，如果是这样，对于塔台与穿越飞机都没有过错，对于离场的320来说，发现可能的问题向塔台证实也是合情合理 。
然而，离场的320机组报告与之相反：飞 机在起飞过程中，发现有架空客330飞机确实在穿越跑道，飞机继续起飞，并且从空客A330上空飞过 。那么从这个来看，事件的性质就完全变了，可能是一起极其严重的跑道侵入事件 。
后来调查组通过分别对事发相关人员进行了调查问询，调取通话录音、雷达录像，并对两架涉事飞机的飞行数据记录器、驾驶舱语音记录器进行了译码 。在2016年10月14日，民航局通报了“10·11”事故调查的初步结论：这是一起塔台管制员遗忘飞机动态、违反工作标准造成的人为原因严重事故征候 。事故中两架飞机垂直距离最短仅19米，翼尖距13米 。性质极为严重，属于A类跑道入侵，险些发生飞机相撞 。对于两个航班的机组通报如下：330机组存在SOP问题，并且在接受了穿越跑道的错误指令后，虽然看到了飞机起飞，但并未提出质疑，但是机组没有机械听从塔台原地等待指令，加速穿越，避免了两机相撞；320机组处置果断操纵正确，避免了事故 。
那么当时为什么会有航空器穿越跑道这一过程呢？当时的虹桥机场为双跑道运行，一般情况下36L/18R起，36R/18L落，落地机组由“东塔台”(负责管理36R/18L跑道)席位指挥给落地指令和脱离，向T2(2号航站楼)方向脱离的话，需要穿越一次跑道，接近36L/18R时东塔台就移交机组给“西塔台” 。
西塔台负责放起飞(管理36L/18R跑道)以及管理B(两条跑道之间的主滑)，D(起飞等待序列，由西地面移交而来)上地面滑行的机组西塔台在确认跑道空闲后给穿越指令或者起飞指令，穿越机组一般从H3(向北运行)或H5(向南运行)穿越跑道，然后左右转加入C，这时才移交给地面席位 。这样来看，虹桥机场穿越跑道是很正常的事，当然了，所有的穿越与起降应该都是在没有影响的情况下进行的，此次事件中，穿越跑道的A330正常来说应该在跑道外等待，当起飞的航班没有影响了，它就可以正常穿越 。因此，从管制方面来看，这个安排没有问题 。下面我们通过分析来看看此次事件是不是人的原因 。

文章插图
虹桥机场图
首先，来看看事发时的虹桥机场天气如何，在1977年3月27日发生的特内里费空难，当时两架大型客机波音747在跑道上相撞，一个很重要的原因就是大雾天气影响了视线 。而在虹桥机场事发时是cavok（其中一个标准是能见度大于10km），这说明当时能见度好，也没有能够影响航空器运行的恶劣天气，下面是当时12点整虹桥机场的天气报文：
ZSSS 110400Z 06005MPS CAVOK 25/11 Q1018 NOSIG（上海机场11日12点，风向60风速5，大晴天，温度25，露点温度11，修正海平面气压1018.未来两小时无变化趋势），至此天气原因可以排除 。

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